2012年5月24日，英国《自然》杂志(Nature)发布了名为《自然出版指数2011-中国》(Nature Publishing Index 2011 China)的报告。报告说，中国目前在《自然》系列期刊上发表论文的比率已经超过6%。报告更提供了大量数据，表明中国在发表论文和科学研究两方面快将成为全球的领导者。

    报告指出，2011年全球在《自然》系列期刊上发表论文的总量为3,425篇，中国在《自然》系列期刊上发表论文的数量为225篇（比率为6.6%），相比2010年的152篇（比率为5.3%），有明显的增长。与2000年的12篇相比，更是不可同日而语。值得关注的是，在2011年发表的225篇论文中，有48篇论文是发表在2010年4月推出的《自然通讯》(Nature Communications)上。

    《自然出版指数2011中国》还利用ISI数据作出了新的分析，发现在全球最有影响力的论文中，也就是引用率最高的1％的论文当中，超过10%是由中国科学家发表的。比率从2001年的1.85％（在6,874篇最有影响力的论文当中占127篇）增加到2011年的11.3％（在10,238篇最有影响力的论文当中占1,158篇），名列全球第四。负责撰写《自然出版指数2011中国》报告和身兼《自然中国》主编的张文浩博士说，美国在发表全球最有影响力的论文方面，比率从2001年的64.3％（在6,874篇最有影响力的论文当中占4,420篇）下降到2011年的50.7％（在10,238篇最有影响力的论文当中占5,190篇）。张博士预计，中国将在2014年超越目前排第二的德国和排第三的英国，成为继美国之后全球最有影响力的科技强国。

    《自然出版指数2011中国》对科研经费、科研机构和城市如何促进了中国科研的急剧发展提供了深入的见解。报告列出了2011年中国十大科研机构的排名：中国科学院、中国科学技术大学、北京大学、清华大学、香港科技大学、厦门大学、上海交通大学、香港大学、南京大学和深圳华大基因。

    中国科学院遥遥领先，总共在《自然》系列期刊上发表了62篇论文。这个不难理解，因为中国科学院拥有超过100所研究所和接近50,000名研究人员。在芸芸大学中，中国科学技术大学的科研实力最强。张文浩说，北大和清华是国家科研的两大巨头，中科大虽然尚未获得和北大或清华一样的名气，但在发表高质量的科研论文方面，三方力量其实是不相上下。

    《自然出版指数2011中国》也提供了城市的排名。在发表高质量的科研论文方面，2011年中国十大城市依次是北京、上海、合肥、香港、南京、武汉、厦门、杭州、深圳和西安。这十个科研城市在《自然》系列期刊上发表论文的总量约占全国86％，并拥有2011年二十大科研机构中的19所。

    《自然出版指数2011中国》以《自然》系列期刊在2011年所发表的论文为基础，衡量不同国家和研究机构的科研实力，并对2010年和2009年的数据进行比较。 张博士指出，自然出版指数分析了科研机构和他们所在的城市，并为评估科研质量提供了新的渠道。